以长江上游经济研究中心、重庆市审计局、重庆市环保局等平台为依托,以环境审计尤其是跨区域、多部门、分层次协同的环境审计理论与实务研究为主攻方向，着力构建长江经济带和三峡库区科学、合理的审计理论体系。包含以下主要研究方向：（1）长江经济带和三峡库区环境与生态工程项目审计、环境保护资金使用和效益审计。主要研究如何通过审计机制维护生态环境发展,确保长江经济带和库区工程长期稳定安全运行以及各项环境保护资金得到合理使用并取得较好效益；（2）长江经济带和三峡库区污染治理与环境审计研究。在对长江经济带和三峡库区环境污染与环境审计的现状评价的基础上，从环境审计视角构建模型对长江经济带和三峡库区环境污染的驱动与制约因素、因果与条件关系等进行定量分析以及对地方政府、企业和第三方的动机、行为、责权利进行合作博弈与动态博弈分析，进而从动力机制、运行机制、评价机制、监督机制四个方面探索环境审计在长江经济带和三峡库区污染治理中的作用机制（包括环境政策评价机制、环境财务审计机制、政府环境绩效审计机制、环境合规审计等）和实现路径（包括环境规制与环境政策评价审计、长江经济带和三峡库区环境保护资金与环境财务审计、长江经济带和三峡库区生态经济责任与政府环境绩效审计、长江经济带和三峡库区社会责任履行与环境合规审计等）；（3）长江经济带和三峡库区跨区域、多部门、分层次环境审计协同机制构建与实现路径研究。重点以长江经济带及三峡库区环境治理中的责任链为主线，按照污染源头及所涉主管部门划分责任并将其固化，提出环境审计基本要点与制度框架，以跨区域、多部门、分层次环境协同联动治理为基础，以生态补偿资金投入、使用绩效为重要抓手，构建长江经济带环境污染治理效果最优的审计协同治理模式（包括审计对象协同、审计标准协同、信息披露协同、结果运用协同、监督机制协同等），促进长江经济带和三峡库区“环境—经济—社会”的协同发展。